В Такаши Ямазаки Годзила минус едно “, публиката се пренася в Япония след Втората световна война, все още олюляваща се от удара на атомните бомби, заплашена от ново чудовище, способно да унищожи градовете с един удар. Главният герой на историята е млад пилот камикадзе на име Коичи Шикишима, който едва оцелява във войната, само за да се приземи в средата на хаоса, нанесен от Годзила. Тъй като създанието става все по-силно с всеки удар, на хората в Токио става ясно, че той трябва да бъде спрян веднъж завинаги, за да могат да се върнат към живота си и да възстановят страната. Но задачата е по-лесно да се каже, отколкото да се направи, тъй като ДНК-то на Годзила го прави неподатлив на смъртта.

Годзила е огромно същество, способно да смаже цели сгради под краката си, но размерът му също го прави по-лесна мишена и много по-лесен за убиване. И като се имат предвид всички неща, които са били хвърлени по него, от куршуми до ядрени бомби до всякакви други чудовища, Годзила щеше да умре със сигурност, ако не беше специална сила в неговата ДНК, която го прави привидно непобедим.
Годзила, подобно на Върколака от вселената на Marvel, има изключителна сила да се лекува. Без значение какво е хвърлено върху него, клетките на създанието ще се регенерират, раните му ще зараснат и то отново ще се изправи на крака. В зависимост от оръжието и тежестта на нанесените му рани, времето за регенерация може да е различно, но независимо какво е, Годзила винаги ще се излекува и ще стане като нов, готов да разкъса враговете си или да ги смачка под краката си.
Именно това специално качество прави клетките на Годзила толкова специални. Наречени G-клетки, тяхната регенеративна сила е достатъчно изкушаваща за учените да се сдобият с тях, но има друго нещо, което ги прави още по-мощни. Тъй като Годзила е радиоактивен, клетките му имат мутативна сила. Това означава, че те могат да доведат до създаването на мутирали същества, по-близки до него по размер и сила, и това е, което учените използват в няколко версии на историята. В „Godzilla Minus One“ специален фокус е поставен върху неговата регенеративна способност, тъй като специалните свойства на G-клетките проправят пътя за бъдещи възможности, една от които е загатната във финалната сцена, когато Шикишима открива, че Норико е жив и се възстановява от нейните рани, нанесени от опустошението на Годзила в Токио.

Пресякъл няколко пъти пътищата на Годзила, Шикишима знае, че не е лесно да убиеш създанието. Никое смъртно оръжие изглежда няма способността да го направи и те са опитали всичко възможно. Но Годзила е опустошил военни кораби и е унищожил градове само с един удар. Как обикновените пистолети и бомби могат да окажат някакво влияние върху него? Шикишима знае това много добре и също така знае, че за да убие Годзила, ще му трябва силата на Годзила.
В последната битка Годзила е привлечен в морето, където планът е да бъде хванат в капан с цилиндри, пълни с фреон, които да го отведат на дъното на океана, където налягането на океана ще го убие. Ако това не се случи, те ще пуснат шамандура, която ще изведе съществото на повърхността с такава скорост, че ще бъде смачкано от натиска. Планът почти работи, докато Годзила не се освобождава от шамандурата и фреона и е готов да изстреля горещата си вълна върху корабите, за да ги унищожи.
Шикишима знаеше, че планът ще се провали, но също така знаеше, че това ще ядоса Годзила достатъчно, за да го накара да използва горещата вълна. Досега човекът също знае, че на създателя му трябват няколко секунди, за да активира енергията и да я освободи. Предусещайки събитията, Шикишима се подготви да направи нещо, което само той можеше. Той беше обучен за пилот камикадзе и макар да избяга от задължението си във войната, той знаеше, че този път трябва да го изпълни или всички да бъдат убити от Годзила. След смъртта на Норико в Гинза, той е мотивиран да отмъсти за нея и войниците, които са били убити от създанието на остров Одо.

Както се очаква, точно когато планът се проваля и Годзила излиза на повърхността, той активира топлинния взрив. Шикишима, който витаеше наблизо, лети към устата му. Самолетът му беше снабден с достатъчно експлозиви, за да унищожи цял град, но Шикишима знаеше, че дори и тогава това нямаше да е достатъчно. Той ще трябва да съобрази експлозията им с горещата вълна на Годзила точно преди да бъде пусната. И така, веднага щом вижда опашката на звяра да посинява от енергия, той си пробива път към него и се протяга точно навреме, за да разбие плана в устата му. Докато самолетът експлодира, пътят за горещата вълна е блокиран и вместо да излезе, тя се взривява в устата му. Въпреки че създадените от човека експлозиви не биха имали въздействие върху Годзила, неговата собствена енергия причинява невероятни щети, взривява главата му на парчета и го хвърля във водата.
Имайки предвид удара, който му беше нанесен, изглежда, че Годзила е свършил завинаги, но последната сцена от филма се движи към парчетата от него, които кипят и започват да се лекуват. Това потвърждава, че Годзила все още не е мъртъв. Може да му отнеме повече време, за да се излекува, защото раните бяха експоненциално по-смъртоносни от това, с което се е сблъсквал преди, но в крайна сметка той отново ще ходи по земята и ще сее хаос.